咽喉囊肿可能是饮食原因、遗传原因、炎症感染等因素所导致，还是要到医院做检查之后才能明确。
1、饮食原因：日常生活中如果经常吃一些辛辣和刺激性比较强的食物，就有可能会对咽喉造成一定的刺激，也可能会造成咽喉囊肿。需要及时的调整好饮食。
2、遗传因素：如果父母一方或者是父母双方有该疾病的情况下，就有可能会遗传给孩子，导致孩子也出现咽喉囊肿。可以通过手术的方法来做切除。
3、炎症感染：咽喉黏膜长期受到慢性炎症感染之后，也可能会造成局部出现隆起性的病变，也会形成咽喉囊肿，会造成局部发生疼痛。可以通过手术切除的方法来做改善。
除了以上原因，也不排除是基因突变因素所导致，要根据囊肿的大小来选择合适治疗措施。